Protein–RNA interactions for Protein: P23297

S100A1, Protein S100-A1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A1P23297 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
S100A1P23297 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
S100A1P23297 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
S100A1P23297 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
S100A1P23297 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
S100A1P23297 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
S100A1P23297 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
S100A1P23297 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
S100A1P23297 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
S100A1P23297 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
S100A1P23297 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
S100A1P23297 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
S100A1P23297 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
S100A1P23297 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
S100A1P23297 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
S100A1P23297 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
S100A1P23297 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
S100A1P23297 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
S100A1P23297 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
S100A1P23297 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
S100A1P23297 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
S100A1P23297 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S100A1P23297 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S100A1P23297 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
S100A1P23297 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
S100A1P23297 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
S100A1P23297 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
S100A1P23297 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
S100A1P23297 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
S100A1P23297 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
S100A1P23297 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
S100A1P23297 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
S100A1P23297 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
S100A1P23297 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S100A1P23297 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S100A1P23297 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
S100A1P23297 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S100A1P23297 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S100A1P23297 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S100A1P23297 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S100A1P23297 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
S100A1P23297 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S100A1P23297 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S100A1P23297 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S100A1P23297 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S100A1P23297 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S100A1P23297 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
S100A1P23297 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
S100A1P23297 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
S100A1P23297 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
S100A1P23297 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
S100A1P23297 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S100A1P23297 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S100A1P23297 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S100A1P23297 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S100A1P23297 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S100A1P23297 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S100A1P23297 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S100A1P23297 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S100A1P23297 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
S100A1P23297 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S100A1P23297 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S100A1P23297 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S100A1P23297 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S100A1P23297 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S100A1P23297 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S100A1P23297 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S100A1P23297 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S100A1P23297 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S100A1P23297 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
S100A1P23297 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
S100A1P23297 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
S100A1P23297 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S100A1P23297 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S100A1P23297 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
S100A1P23297 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
S100A1P23297 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
S100A1P23297 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
S100A1P23297 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
S100A1P23297 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S100A1P23297 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S100A1P23297 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S100A1P23297 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S100A1P23297 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
S100A1P23297 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S100A1P23297 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S100A1P23297 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S100A1P23297 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S100A1P23297 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S100A1P23297 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
S100A1P23297 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S100A1P23297 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S100A1P23297 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S100A1P23297 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S100A1P23297 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S100A1P23297 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S100A1P23297 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
S100A1P23297 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S100A1P23297 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S100A1P23297 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms