Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRP12270 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPRP12270 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRP12270 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPRP12270 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPRP12270 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TPRP12270 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRP12270 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRP12270 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPRP12270 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRP12270 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRP12270 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRP12270 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRP12270 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPRP12270 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRP12270 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRP12270 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPRP12270 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRP12270 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRP12270 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRP12270 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPRP12270 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRP12270 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRP12270 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRP12270 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRP12270 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRP12270 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TPRP12270 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPRP12270 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPRP12270 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPRP12270 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPRP12270 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRP12270 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRP12270 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRP12270 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TPRP12270 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPRP12270 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPRP12270 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPRP12270 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRP12270 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRP12270 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPRP12270 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRP12270 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRP12270 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPRP12270 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPRP12270 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPRP12270 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPRP12270 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRP12270 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRP12270 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRP12270 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPRP12270 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRP12270 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRP12270 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRP12270 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRP12270 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRP12270 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPRP12270 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TPRP12270 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRP12270 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRP12270 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPRP12270 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRP12270 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPRP12270 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRP12270 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPRP12270 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPRP12270 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRP12270 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPRP12270 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRP12270 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPRP12270 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRP12270 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRP12270 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPRP12270 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRP12270 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPRP12270 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRP12270 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRP12270 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TPRP12270 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPRP12270 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPRP12270 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPRP12270 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRP12270 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TPRP12270 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPRP12270 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPRP12270 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPRP12270 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRP12270 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRP12270 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRP12270 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TPRP12270 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPRP12270 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPRP12270 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRP12270 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPRP12270 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRP12270 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TPRP12270 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRP12270 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TPRP12270 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TPRP12270 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms