Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
RGPD1P0DJD0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
RGPD1P0DJD0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
RGPD1P0DJD0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
RGPD1P0DJD0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
RGPD1P0DJD0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
RGPD1P0DJD0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
RGPD1P0DJD0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
RGPD1P0DJD0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
RGPD1P0DJD0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
RGPD1P0DJD0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
RGPD1P0DJD0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
RGPD1P0DJD0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RGPD1P0DJD0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
RGPD1P0DJD0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RGPD1P0DJD0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RGPD1P0DJD0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
RGPD1P0DJD0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
RGPD1P0DJD0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms