Protein–RNA interactions for Protein: P01594

IGKV1-33, Immunoglobulin kappa variable 1-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-33P01594 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1-33P01594 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1-33P01594 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1-33P01594 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-33P01594 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-33P01594 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGKV1-33P01594 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGKV1-33P01594 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1-33P01594 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1-33P01594 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1-33P01594 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGKV1-33P01594 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGKV1-33P01594 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGKV1-33P01594 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV1-33P01594 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms