Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC38.86■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.83■■■■□ 3.81
POLR1AO95602 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
POLR1AO95602 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
POLR1AO95602 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.65■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
POLR1AO95602 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
POLR1AO95602 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
POLR1AO95602 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
POLR1AO95602 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
POLR1AO95602 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
POLR1AO95602 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
POLR1AO95602 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
POLR1AO95602 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
POLR1AO95602 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
POLR1AO95602 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
POLR1AO95602 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
POLR1AO95602 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
POLR1AO95602 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
POLR1AO95602 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
POLR1AO95602 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.52■■■■□ 3.76
POLR1AO95602 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
POLR1AO95602 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
POLR1AO95602 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
POLR1AO95602 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms