Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNAPINO95295 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNAPINO95295 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SNAPINO95295 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SNAPINO95295 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SNAPINO95295 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms