Protein–RNA interactions for Protein: O00562

PITPNM1, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM1O00562 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PITPNM1O00562 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PITPNM1O00562 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PITPNM1O00562 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PITPNM1O00562 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PITPNM1O00562 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PITPNM1O00562 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PITPNM1O00562 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PITPNM1O00562 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PITPNM1O00562 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PITPNM1O00562 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PITPNM1O00562 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PITPNM1O00562 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PITPNM1O00562 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PITPNM1O00562 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PITPNM1O00562 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms