Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc9bA3KGF9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc9bA3KGF9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc9bA3KGF9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc9bA3KGF9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc9bA3KGF9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc9bA3KGF9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc9bA3KGF9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc9bA3KGF9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc9bA3KGF9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc9bA3KGF9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc9bA3KGF9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc9bA3KGF9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc9bA3KGF9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms