RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000112509.1

Rbms1-202, Transcript of RNA-binding motif, single-stranded-interacting protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Rbms1, Length 1,806 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa53,42■■■■■ 6,14
Rbms1-202ENSMUST00000112509 NischQ80TM9 1593 aa53,21■■■■■ 6,11
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Abcc9P70170 1546 aa51,65■■■■■ 5,86
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Abcc8B2RUS7 1588 aa51,15■■■■■ 5,78
Rbms1-202ENSMUST00000112509 ScribQ80U72 1612 aa48,65■■■■■ 5,38
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Dcaf1Q80TR8 1506 aa47,43■■■■■ 5,18
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Kdm5dQ62240 1548 aa47,31■■■■■ 5,16
Rbms1-202ENSMUST00000112509 NacadQ5SWP3 1504 aa47,24■■■■■ 5,15
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Rhox8Q6VSS7 320 aa47,03■■■■■ 5,12
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa46,47■■■■■ 5,03
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Sycp2Q9CUU3 1500 aa46,28■■■■■ 5
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Ccdc180J3QNE4 1664 aa46,02■■■■■ 4,96
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Baz1aO88379 1555 aa45,91■■■■■ 4,94
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Crybg2B7ZCC2 1516 aa45,57■■■■■ 4,89
Rbms1-202ENSMUST00000112509 BicraF8VPZ9 1578 aa45,47■■■■■ 4,87
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP45,01■■■■■ 4,8
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Rtl1Q7M732 1744 aa44,87■■■■■ 4,77
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Smarca2Q6DIC0 1577 aa44,7■■■■■ 4,75
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa44,1■■■■■ 4,65
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP43,92■■■■■ 4,62
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa43,85■■■■■ 4,61
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP43,84■■■■■ 4,61
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP43,76■■■■■ 4,6
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP43,48■■■■■ 4,55
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa43,44■■■■■ 4,54
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Synj1Q8CHC4 1574 aa43,32■■■■■ 4,53
Rbms1-202ENSMUST00000112509 CftrP26361 1476 aa43,31■■■■■ 4,52
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Trim41Q5NCC3 630 aa43,24■■■■■ 4,51
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa43,19■■■■■ 4,5
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP43,15■■■■■ 4,5
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Ercc6F8VPZ5 1481 aa43■■■■■ 4,47
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Wdr62Q3U3T8 1523 aa42,91■■■■■ 4,46
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Frmpd1A2AKB4 1549 aa42,86■■■■■ 4,45
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa42,53■■■■■ 4,4
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP42,53■■■■■ 4,4
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa42,49■■■■■ 4,39
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Fam135aQ6NS59 1506 aa42,41■■■■■ 4,38
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Golga3P55937 1487 aa42,38■■■■■ 4,38
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP42,33■■■■■ 4,37
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Unc13aQ4KUS2 1712 aa42,28■■■■■ 4,36
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Top2bQ64511 1612 aa42,19■■■■■ 4,34
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Cngb1E1AZ71 1325 aa42,12■■■■■ 4,33
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Baz1bQ9Z277 1479 aa41,9■■■■■ 4,3
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Ubl4bQ9CQ84 188 aa41,85■■■■■ 4,29
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP41,84■■■■■ 4,29
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Lamc3Q9R0B6 1581 aa41,77■■■■■ 4,28
Rbms1-202ENSMUST00000112509 HrcG5E8J6 738 aa41,75■■■■■ 4,27
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Kif15Q6P9L6 1387 aa41,67■■■■■ 4,26
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Fmn1Q05860 1466 aa41,66■■■■■ 4,26
Rbms1-202ENSMUST00000112509 TnnQ80Z71 1560 aa41,65■■■■■ 4,26
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa41,55■■■■■ 4,24
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Mrc2Q64449 1479 aa41,4■■■■■ 4,22
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Cux2P70298 1426 aa41,4■■■■■ 4,22
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Chic1Q8CBW7 227 aa41,39■■■■■ 4,22
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Cep164Q5DU05 1446 aa41,22■■■■■ 4,19
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Camsap1A2AHC3 1581 aa41,14■■■■■ 4,18
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP41,11■■■■■ 4,17
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Ccdc18Q640L5 1455 aa41,1■■■■■ 4,17
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP41■■■■■ 4,15
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Il27Q8K3I6 234 aa40,93■■■■■ 4,14
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Kif21aQ9QXL2 1672 aa40,81■■■■■ 4,12
Rbms1-202ENSMUST00000112509 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP40,75■■■■■ 4,11
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Grin2bQ01097 1482 aa40,7■■■■■ 4,11
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP40,62■■■■■ 4,09
Rbms1-202ENSMUST00000112509 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP40,61■■■■■ 4,09
Rbms1-202ENSMUST00000112509 NrkQ9R0G8 1455 aa40,55■■■■■ 4,08
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Gab3Q8BSM5 595 aa40,51■■■■■ 4,07
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Duox2A2AQ99 1517 aa40,44■■■■■ 4,06
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Crocc2F6XLV1 1638 aa40,42■■■■■ 4,06
Rbms1-202ENSMUST00000112509 PtprkP35822 1457 aa40,41■■■■■ 4,06
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Shroom4Q1W617 1475 aa40,41■■■■■ 4,06
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa40,41■■■■■ 4,06
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Efcab5A0JP43 1406 aa40,37■■■■■ 4,05
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa40,35■■■■■ 4,05
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Plb1Q3TTY0 1478 aa40,26■■■■■ 4,04
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP40,26■■■■■ 4,03
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Samd9lQ69Z37 1561 aa40,15■■■■■ 4,02
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Npm2Q80W85 207 aa40,13■■■■■ 4,01
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Cep162Q6ZQ06 1403 aa40,04■■■■■ 4
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP40,03■■■■■ 4
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Ift140E9PY46 1464 aa39,97■■■■□ 3,99
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Arhgap35Q91YM2 1499 aa39,94■■■■□ 3,98
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa39,92■■■■□ 3,98
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Disp1Q3TDN0 1521 aa39,89■■■■□ 3,98
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Map3k1P53349 1493 aa39,86■■■■□ 3,97
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Rad54l2Q99NG0 1466 aa39,85■■■■□ 3,97
Rbms1-202ENSMUST00000112509 SynmQ70IV5 1561 aa39,84■■■■□ 3,97
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP39,84■■■■□ 3,97
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Rbms1-202ENSMUST00000112509 Magi3Q9EQJ9 1476 aa39,73■■■■□ 3,95
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP39,7■■■■□ 3,95
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Rbms1-202ENSMUST00000112509 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP39,66■■■■□ 3,94
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Pla2r1Q62028 1487 aa39,62■■■■□ 3,93
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Setd1bQ8CFT2 1985 aa39,6■■■■□ 3,93
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Myt1lP97500 1187 aa39,6■■■■□ 3,93
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Rusc2Q80U22 1514 aa39,58■■■■□ 3,93
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Carmil1Q6EDY6 1374 aa39,58■■■■□ 3,93
Rbms1-202ENSMUST00000112509 Gpatch8A2A6A1 1505 aa39,56■■■■□ 3,92
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