RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000009241.5

Tbx1-201, Transcript of T-box transcription factor TBX1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tbx1, Length 1,777 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa51.8■■■■■ 5.88
Tbx1-201ENSMUST00000009241 NischQ80TM9 1593 aa51.76■■■■■ 5.88
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Abcc9P70170 1546 aa50.28■■■■■ 5.64
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Abcc8B2RUS7 1588 aa49.57■■■■■ 5.53
Tbx1-201ENSMUST00000009241 ScribQ80U72 1612 aa46.81■■■■■ 5.08
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Dcaf1Q80TR8 1506 aa46.25■■■■■ 4.99
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Rhox8Q6VSS7 320 aa46.19■■■■■ 4.98
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Kdm5dQ62240 1548 aa45.67■■■■■ 4.9
Tbx1-201ENSMUST00000009241 NacadQ5SWP3 1504 aa45.63■■■■■ 4.9
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa45.25■■■■■ 4.83
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Ccdc180J3QNE4 1664 aa45.09■■■■■ 4.81
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Rtl1Q7M732 1744 aa44.93■■■■■ 4.78
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Baz1aO88379 1555 aa44.76■■■■■ 4.76
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Sycp2Q9CUU3 1500 aa44.63■■■■■ 4.74
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Crybg2B7ZCC2 1516 aa44.43■■■■■ 4.7
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP43.74■■■■■ 4.59
Tbx1-201ENSMUST00000009241 BicraF8VPZ9 1578 aa43.69■■■■■ 4.59
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Smarca2Q6DIC0 1577 aa43.62■■■■■ 4.57
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa42.91■■■■■ 4.46
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa42.69■■■■■ 4.42
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP42.52■■■■■ 4.4
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Trim41Q5NCC3 630 aa42.51■■■■■ 4.4
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP42.44■■■■■ 4.38
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Synj1Q8CHC4 1574 aa42.15■■■■■ 4.34
Tbx1-201ENSMUST00000009241 CftrP26361 1476 aa42.11■■■■■ 4.33
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa42.07■■■■■ 4.33
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa41.96■■■■■ 4.31
Tbx1-201ENSMUST00000009241 HrcG5E8J6 738 aa41.72■■■■■ 4.27
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Golga3P55937 1487 aa41.55■■■■■ 4.24
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Ercc6F8VPZ5 1481 aa41.39■■■■■ 4.22
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Wdr62Q3U3T8 1523 aa41.36■■■■■ 4.21
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Top2bQ64511 1612 aa41.31■■■■■ 4.2
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Frmpd1A2AKB4 1549 aa41.26■■■■■ 4.2
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Cngb1E1AZ71 1325 aa41.24■■■■■ 4.19
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Cep164Q5DU05 1446 aa40.96■■■■■ 4.15
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa40.91■■■■■ 4.14
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa40.9■■■■■ 4.14
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP40.83■■■■■ 4.13
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Fmn1Q05860 1466 aa40.79■■■■■ 4.12
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa40.76■■■■■ 4.12
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Unc13aQ4KUS2 1712 aa40.75■■■■■ 4.11
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Fam135aQ6NS59 1506 aa40.72■■■■■ 4.11
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Chic1Q8CBW7 227 aa40.6■■■■■ 4.09
Tbx1-201ENSMUST00000009241 TnnQ80Z71 1560 aa40.58■■■■■ 4.09
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Lamc3Q9R0B6 1581 aa40.54■■■■■ 4.08
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Baz1bQ9Z277 1479 aa40.39■■■■■ 4.06
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Kif15Q6P9L6 1387 aa40.31■■■■■ 4.04
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Ubl4bQ9CQ84 188 aa40.25■■■■■ 4.03
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Camsap1A2AHC3 1581 aa39.98■■■■□ 3.99
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Ccdc18Q640L5 1455 aa39.96■■■■□ 3.99
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Cux2P70298 1426 aa39.93■■■■□ 3.98
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Gab3Q8BSM5 595 aa39.87■■■■□ 3.97
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Mrc2Q64449 1479 aa39.8■■■■□ 3.96
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa39.76■■■■□ 3.95
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP39.64■■■■□ 3.94
Tbx1-201ENSMUST00000009241 NrkQ9R0G8 1455 aa39.61■■■■□ 3.93
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Il27Q8K3I6 234 aa39.6■■■■□ 3.93
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Grin2bQ01097 1482 aa39.59■■■■□ 3.93
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Shroom4Q1W617 1475 aa39.47■■■■□ 3.91
Tbx1-201ENSMUST00000009241 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP39.46■■■■□ 3.91
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Cep162Q6ZQ06 1403 aa39.41■■■■□ 3.9
Tbx1-201ENSMUST00000009241 PogzQ8BZH4 1409 aaKnown RBP39.36■■■■□ 3.89
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP39.35■■■■□ 3.89
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Npm2Q80W85 207 aa39.35■■■■□ 3.89
Tbx1-201ENSMUST00000009241 PtprkP35822 1457 aa39.34■■■■□ 3.89
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Efcab5A0JP43 1406 aa39.29■■■■□ 3.88
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Kif21aQ9QXL2 1672 aa39.26■■■■□ 3.88
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Dhx29Q6PGC1 1365 aaKnown RBP39.21■■■■□ 3.87
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Duox2A2AQ99 1517 aa39.2■■■■□ 3.87
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Map3k1P53349 1493 aa39.14■■■■□ 3.86
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Arhgap35Q91YM2 1499 aa39.12■■■■□ 3.85
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Crocc2F6XLV1 1638 aa39.09■■■■□ 3.85
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa39.01■■■■□ 3.84
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Lrriq1Q0P5X1 1673 aa38.92■■■■□ 3.82
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Samd9lQ69Z37 1561 aa38.9■■■■□ 3.82
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Myt1lP97500 1187 aa38.88■■■■□ 3.81
Tbx1-201ENSMUST00000009241 AqrQ8CFQ3 1481 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Zeb1Q64318 1117 aa38.81■■■■□ 3.8
Tbx1-201ENSMUST00000009241 SynmQ70IV5 1561 aa38.79■■■■□ 3.8
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Clip1Q922J3 1391 aa38.77■■■■□ 3.8
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Plb1Q3TTY0 1478 aa38.74■■■■□ 3.79
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Urb2E9Q7L1 1524 aaKnown RBP38.71■■■■□ 3.79
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP38.68■■■■□ 3.78
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Carmil1Q6EDY6 1374 aa38.67■■■■□ 3.78
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Ift140E9PY46 1464 aa38.6■■■■□ 3.77
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Rad54l2Q99NG0 1466 aa38.55■■■■□ 3.76
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Eea1Q8BL66 1411 aa38.54■■■■□ 3.76
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Pbrm1Q8BSQ9 1634 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Disp1Q3TDN0 1521 aa38.5■■■■□ 3.75
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Polr1aO35134 1717 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Magi3Q9EQJ9 1476 aa38.46■■■■□ 3.75
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Gpatch8A2A6A1 1505 aa38.44■■■■□ 3.74
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Grin2aP35436 1464 aa38.42■■■■□ 3.74
Tbx1-201ENSMUST00000009241 Pla2r1Q62028 1487 aa38.41■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 9.5 ms