Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC26A0AVF1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC26A0AVF1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC26A0AVF1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC26A0AVF1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TTC26A0AVF1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTC26A0AVF1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTC26A0AVF1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TTC26A0AVF1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC26A0AVF1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC26A0AVF1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC26A0AVF1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC26A0AVF1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC26A0AVF1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTC26A0AVF1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TTC26A0AVF1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TTC26A0AVF1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
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