Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CAMTA1Q9Y6Y1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CAMTA1Q9Y6Y1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms