Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLC4A4Q9Y6R1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC4A4Q9Y6R1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms