Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LRP12Q9Y561 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LRP12Q9Y561 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms