Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
USP15Q9Y4E8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
USP15Q9Y4E8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms