Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

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Length 3,996 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HECTD4Q9Y4D8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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HECTD4Q9Y4D8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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HECTD4Q9Y4D8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
HECTD4Q9Y4D8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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