Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CHTOPQ9Y3Y2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CHTOPQ9Y3Y2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms