Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
HIF3AQ9Y2N7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HIF3AQ9Y2N7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms