Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y223

GNE, Bifunctional UDP-N-acetylglucosamine 2-epimerase/N-acetylmannosamine kinase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNEQ9Y223 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GNEQ9Y223 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GNEQ9Y223 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms