Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TTF2Q9UNY4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TTF2Q9UNY4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms