Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
L1RE1Q9UN81 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
L1RE1Q9UN81 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms