Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CAPN11Q9UMQ6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CAPN11Q9UMQ6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms