Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TTC7AQ9ULT0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.33■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TTC7AQ9ULT0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.3■■□□□ 1
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