Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BRPF3Q9ULD4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BRPF3Q9ULD4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms