Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TRAPPC2LQ9UL33 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms