Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CROTQ9UKG9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms