Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
USP21Q9UK80 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
USP21Q9UK80 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
USP21Q9UK80 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms