Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SALL4Q9UJQ4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SALL4Q9UJQ4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms