Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

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Length 781 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SIX4Q9UIU6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SIX4Q9UIU6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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