Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPN3Q9UHW5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPN3Q9UHW5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms