Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HMGXB4Q9UGU5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HMGXB4Q9UGU5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms