Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
KDM5BQ9UGL1 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KDM5BQ9UGL1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms