Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DUX4Q9UBX2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms