Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NLKQ9UBE8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NLKQ9UBE8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms