Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARHGAP28Q9P2N2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARHGAP28Q9P2N2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms