Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
RRBP1Q9P2E9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC31■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
RRBP1Q9P2E9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms