Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COL20A1Q9P218 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COL20A1Q9P218 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms