Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0U4

CXXC1, CXXC-type zinc finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXXC1Q9P0U4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXXC1Q9P0U4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXXC1Q9P0U4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms