Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PKD2L1Q9P0L9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PKD2L1Q9P0L9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms