Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TVP23BQ9NYZ1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TVP23BQ9NYZ1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms