Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZDHHC3Q9NYG2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ZDHHC3Q9NYG2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms