Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VNN3Q9NY84 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VNN3Q9NY84 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms