Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY65

TUBA8, Tubulin alpha-8 chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA8Q9NY65 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TUBA8Q9NY65 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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TUBA8Q9NY65 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TUBA8Q9NY65 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
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