Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM30AQ9NV96 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM30AQ9NV96 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms