Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TMPRSS4Q9NRS4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms