Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GPHNQ9NQX3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GPHNQ9NQX3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms