Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP87

POLM, DNA-directed DNA/RNA polymerase mu, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLMQ9NP87 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POLMQ9NP87 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms