Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP79

VTA1, Vacuolar protein sorting-associated protein VTA1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTA1Q9NP79 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VTA1Q9NP79 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTA1Q9NP79 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms