Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS5

EPB41L4A, Band 4.1-like protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4AQ9HCS5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L4AQ9HCS5 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L4AQ9HCS5 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms