Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LGR6Q9HBX8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LGR6Q9HBX8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms